2023年11月5日起,“系统生物学系列讲座”将从开始第一讲,后续每两周进行一期,将涉及系统生物学的基础理论、常用方法、以及在生物医学问题中的具体应用研究。
该系列讲座由中国生物信息学学会(筹)系统生物学专业委员会主办,通过B站进行在线直播。
雷峰网《医健AI掘金志》作为大会首席合作媒体,将全程参与报道。
系统生物专委会,于2023年8月25日正式成立,拥有专委会委员60余名。专业委员会的成立,旨在凝聚国内力量,培养人才团队,推动学科发展,扩大学科影响。
一方面,促进系统生物学理论基础、技术框架的交流构建,揭示疾病演化的驱动力及规律;
另一方面,推动基于系统生物学的新技术新产品研发,解决生命医学研究碎片化、重大产品和系统缺失等重点难点问题,最终更好地服务于满足人民健康需求、推动新型医学发展、服务于国民社会经济的国家战略。
迄今为止,系统生物学专业委员会已采取3种形式的学术交流活动:
1. 从2023年起,定期举办“系统生物学” 线上讲座;
2. 设立“系统生物学”暑期课程;
3. 在现有“肿瘤系统生物学国际研讨会” 【ICSB年度会议】的基础上,举办“系统生物学全国学术大会”。
今年8月26日-27日,由系统生物学专委会联合主办的“第十二届肿瘤系统生物学国际研讨会”已顺利召开,由系统生物学专委会主任、南科大医学院讲席教授徐鹰任大会主席,20位国内外专家进行了精彩报告。该会议共吸引了三百余人在现场参会,一万九千多人在网上参加。
系统生物学系列讲座目前已经确定的特邀报告人依次(按照讲座日期顺序)为:
南方科技大学徐鹰教授(11月5日)
苏州大学时玉舫教授(欧洲科学院院士)(11月19日)
Nature Methods资深编辑Arunima Singh博士(12月3日)
纽约州立大学石溪分校汪劲教授(12月17日)
中国科学院上海生命科学研究院陈洛南研究员(1月21日)
北京大学韩敬东教授(2月4日)
中国科学院数学与系统科学研究院李雷研究员(2月18日)
西安交通大学于军教授(兼任GPB 主编)(3月3日)
Nature Communications副编辑程谦博士(3月17日)
北京大学来鲁华教授(3月31日)
除程谦博士讲座于当天北京时间晚8点-9点半进行外,其余均于上午9点-10点半进行。包含50分钟报告时间,40分钟讨论时间。
B站直播二维码如下,欢迎大家扫码并积极极参与。
徐鹰 ,南方科技大学医学院讲习教授
徐鹰 ,南方科技大学医学院讲习教授,获国家级人才头衔,计算系统生物学及生物信息学者。研究方向为肿瘤系统生物学。
2023年1月加入南方科技大学医学院,之前为美国佐治亚大学生物化学系“校董事会教授”及“佐治亚科学协会著名学者讲席教授”(2003-2022),佐治亚大学生物信息研究所首任所长(2003-2011)。
他是AAAS Fellow及IEEE Fellow。1991年获得美国科罗拉多大学计算机科学博士学位(组合数学和算法)。1993年加入美国橡树岭国家实验室,工作十年,历任助理研究员、研究员、资深研究员及课题组长(senior staff scientist and group leader)。2003年,他的研究团队加盟佐治亚大学,成立生物信息研究所,同时入职佐治亚大学生化系。自2008年起,开始通过肿瘤组学数据研究肿瘤发生、发展、转移的推手和机理。
目前徐鹰共发表近400篇学术论文,五部著作,包括世界上第一部“肿瘤信息学”专著,引文 19500余次、H指数为70。自2003年起,每年在国内主持召开“生物信息学国际研讨会(2003-2013),及“肿瘤系统生物学国际研讨会”(2011年起),并每年主讲“生物信息学”或“肿瘤信息学”暑期课程,共吸引3万余人参加。
时玉舫,苏州大学转化医学研究院院长
时玉舫,苏州大学转化医学研究院院长,长期从事免疫与干细胞研究。
1982年本科毕业于山东农学院(现为山东农业大学),1982年至1985年在山东农学院畜牧兽医系担任助教,1988年和1992年在加拿大阿尔伯塔大学获硕士和博士学位,1992年至1995年在加拿大多伦多大学从事博士后研究。1995年至2001年任教于美国乔治•华盛顿大学微生物与免疫学系和美国红十字会赫兰生物医学研究所免疫学系。2001年至2008年,在美国新泽西医科齿科大学罗伯特•强生医学院分子遗传、微生物和免疫学系任终身教授和特聘大学教授。2008年至2014年,任中国科学院上海生命科学院/上海交通大学医学院健康科学研究所所长、研究员。现任苏州大学转化医学研究院院长。
他长期从事免疫与干细胞研究,在探索免疫稳态维持和组织再生修复的细胞与分子机制等方面取得了一系列原创性、突破性和引领性成果。迄今为止,世界上对干细胞与免疫反应相互调控的认知大多源于时玉舫及其团队的科学发现。
Arunima Singh,Nature Methods资深编辑
现任Nature Methods资深编辑。计算结构生物学家,研究领域包括分子建模,蛋白质-碳水化合物和蛋白质-蛋白质相互作用。古吉拉特大学生物化学理学学士、浦那大学生物信息学硕士、佐治亚大学生物信息学博士。
汪劲,纽约州立大学石溪分校教授
汪劲,现任纽约州立大学石溪分校化学和物理及天文系教授,主要从事专业为生物物理、计算生物物理、结构生物学等研究,建立了势和流的景观理论并广泛应用于各类生物及复杂系统。提出了量化特异性的概念和方法并应用于药物设计。
1984年本科毕业于吉林大学物理系,1991年博士毕业于伊利诺斯大学天体物理学,1996年在伊利诺斯大学完成化学和生物物理博士后训练,2000年获得美国纽约大学石溪分校工商管理硕士。
曾任花旗银行全球战略分析部资深分析师及副总裁。欧洲科学院院士,美国科学促进学会会士,美国物理学会会士。
陈洛南,中国科学院上海生命科学研究院研究员
陈洛南,中国科学院上海生命科学研究院研究员,长期采用系统工程、动力学建模等方式研究复杂疾病的发生机制。
1984年本科毕业于华中科技大学电气工程专业,1988年和1991年分别获日本东北大学系统科学硕士、博士学位。1997年起在日本大阪产业大学电气工程和电子学院任教,在日本和美国从事科研教学工作等25年以上,2009年10月加入中科院上海生命科学研究院。
近年来,在系统生物学和复杂网络等研究领域发表了350余篇期刊论文及10余部编著书籍,论文总引用超2万次。并担任中国生物化学与分子生物学会分子系统生物学专业分会主任委员,IEEE-SMC系统生物学委员会主席,中国运筹学会计算系统生物学分会名誉理事长,中国药理学会网络药理学专业委员会副主任委员等。
韩敬东,北京大学教授
韩敬东,北京大学定量生物学中心研究员、北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员,现任计算生物学所所长。
1991年获中国药科大学学士,1996年获Albert Einstein College of Medicine 博士、1997-1998年,The Rockefeller University 博士后,1999-2002年进入业界担任IT软件工程师,2002-2004年为Dana Farber Cancer Institute and Harvard Medical School博士后。
研究领域包括发育与衰老的系统生物学、调控网络的计算推理、图像分析,数据集成和网络分析的计算算法开发。
李雷,中国科学院数学与系统科学研究院研究员
李雷,中国科学院数学与系统科学研究院关肇直首席研究员。研究方向包括计算生物学与基因组学、长寿与衰老机制、统计建模与统计计算、时间序列分析、和信息论。
于北京大学获得学士和硕士学位,1998年于美国加州大学伯克利分校统计系获博士学位。2000年9月- 2002年12月加利福尼亚大学洛杉矶分校,纯粹与应用数学研究所,博士后。2002-2010 年在南加利福尼亚大学计算生物及数学系任教并于2005年获得终身职务。
李雷博士与国际著名统计学家、澳大利亚科学院院士 Terence P. Speed教授,计算生物学的先驱、美国科学院院士Michael Waterman教授,老龄研究专家Valter Longo教授等长期合作并取得重要成果。李雷博士与Speed教授发展的DNA测光度校正方法已成为新一代Illumina/Solexa快速测序仪的工业标准。2010年入选中国科学院“百人计划(国外杰出人才)”。
于军,西安交通大学教授
于军,西安交通大学国家生物安全证据基地、北京基因组研究所(国家生物信息中心)荣誉教授,兼任GPB(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,基因组蛋白质组与生物信息学报)主编。
研究领域包括基因组学、生物信息学、生物医学仪器。
1983年毕业于吉林大学生化专业,同年考入中科院生物物理所读研,并考取CUSBEA奖学金,于1984年赴美国纽约大学医学院攻读生物医学博士。1990年获得博士学位后在NYU任研究助理教授,1993年加盟华盛顿大学(西雅图)基因组科学系,参与国际人类基因组计划,从事基因组学和生物信息学研究,同时开发相关科学实验设备与仪器。
于军博士1998年归国后先后参与组建了“华大基因”,中科院北京基因组研究所(包括国家生物信息中心和国家基因组数据中心),参与并主持了国际人类基因组计划(中国部分),以及超级杂交水稻、家蚕、鸡、椰枣、人参、鲤鱼等大型基因组研究计划,两次担任国家973计划的首席科学家。
程谦,Nature Communications副编辑
先后毕业于英国牛津大学、剑桥大学,英国牛津大学Weatherall分子医学研究所计算生物学中心博士后研究员,合作导师为Edward Morrissey博士,研究方向是通过开发和应用数学与统计模型研究组织内的干细胞命运。2022年9月起担任Nature Communications副编辑。
来鲁华,北京大学化学与分子工程学院长江特聘教授
来鲁华,北京大学化学与分子工程学院长江特聘教授、副院长、物理化学研究所所长,北京大学定量生物学中心副主任,北京大学-清华大学生命科学联合中心成员。
研究领域为化学与生物学的交叉研究,主要方向是采用理论计算与实验密切结合的方法定量研究生物分子作用机制并进行蛋白质、药物和生物系统设计。
1984年至1989年,先后在北京大学化学系完成本硕博学习,1998-1999年,美国加州大学伯克莱分校化学系伯克莱学者。1992年至今担任北京大学化学学院教授,2001年被评为北京大学化学学院长江特聘教授。
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